Comparaison de techniques d’identification des Erwinia et des Pseudomonas responsables de la pourriture molle

Résumé

Trois méthodes, soit la caractérisation physiologique, l'utilisation de systèmes miniaturisés d'identification (API 20E, API NFT et Biolog) et l'analyse du profil électrophorétique des protéines sécrétées, ont été expérimentées afin de déterminer une technique précise et rapide d'identification des Pseudomonas et des Erwinia responsables de la pourriture molle. L'analyse des patrons électrophorétiques des protéines sécrétées est une méthode très efficace pour identifier les différentes espèces pectinolytiques de Pseudomonas fluorescents. Le système Biolog reconnaît efficacement le P. marginalis et le P. viridiflava. Le système API NFT est efficace pour l'identification du P. marginalis, du P. viridiflava et du P. syringae. C'est le système API 20E qui s'est avéré le plus efficace pour l'identification des Erwinia. L'électrophorèse des protéines sécrétées et le système API NFT permettent une identification rapide et efficace des Pseudomonas, tandis que pour les Erwinia, seul le système API20E est performant.

Abstract

Three methods, namely physiological characterization, the use of miniaturized identification Systems (API 20E, API NFT, and Biolog) and the analysis of the electrophoretic profile of proteins secreted by the bacteria, were used in order to determine a precise and quick identification technique for the Pseudomonas and Erwinia species causing soft rots in several plant species. The analysis of the electrophoretic profile of the proteins secreted is a very efficient method of identification for the various pectinolytic species of fluorescent Pseudomonas. The Biolog System accurately recognizes P. marginalisand P. viridiflava. The API NFT System is efficient for the identification of P. marginalis, P. viridiflava and P. syringae. The API 20E System was found to be the most reliable System for identifying Erwinia species. The electrophoresis of proteins secreted and the API NFT system allow a quick and efficient identification of Pseudomonas species, while for Erwinia species, only the API 20E System is efficient.